Desarrollo de técnicas diagnósticas que faciliten el muestreo, diagnóstico y control de la Diarrea Viral Bovina en establecimientos lecheros de la provincia de Santa Fe

Abstract

La Diarrea Viral Bovina (DVB) se presenta con múltiples cuadros y genera importantes pérdidas económicas a nivel mundial. La presente tesis tuvo como objetivo general mejorar las posibilidades diagnósticas de la DVB en rodeos lecheros de la provincia de Santa Fe, así como obtener datos actualizados de prevalencia y genotipos circulantes. Se desarrollaron técnicas y procedimientos diagnósticos que permitan facilitar la toma y remisión de muestras, la conservación del ARN viral y la detección molecular del virus de la Diarrea Viral Bovina (VDVB), incluyendo una RT-qPCR, así como un método de procesamiento de muestras sembradas en papeles de filtro para preservar material genético viral. Además, se incluyeron estudios de estimación de prevalencia de anticuerpos anti-VDVB realizados en muestras de leche de tanque, un plan de monitoreo de la enfermedad en un establecimiento de la región y un estudio filogenético donde se clasificaron genéticamente las cepas del VDVB encontradas. Esta tesis permitió desarrollar una RT-qPCR altamente sensible que detecta todos los genotipos bovinos hallados en la región. Además, pudo recuperarse ARN del VDVB por hasta 12 meses en papel cromatográfico y tarjetas FTA. Respecto al establecimiento monitoreado, no se encontró circulación viral. Mediante una estimación de la prevalencia, se observó una alta circulación viral en la cuenca lechera de Santa Fe. Las muestras secuenciadas indican mayor circulación de genotipo 1b. Se logró obtener datos actualizados de la DVB en Santa Fe, que reflejan la necesidad de implementar planes de control a nivel regional.

Bovine Viral Diarrhea (BVD) is a complex disease with several clinical manifestations that causes significant economic losses worldwide. The overall objective of this thesis was to improve the diagnostic possibilities of BVD in dairy herds in the province of Santa Fe, as well as to update data on prevalence and circulating genotypes. Diagnostic techniques and procedures were developed to facilitate sample collection and shipping, viral RNA preservation, and molecular detection of the Bovine Viral Diarrhea virus (BVDV), including a RT-qPCR technique and a method for processing samples sown in filter paper to preserve viral genetic material. In addition, studies estimating the prevalence of anti-BVDV antibodies in bulk tank milk samples, a disease monitoring plan at a dairy farm in the region, and a phylogenetic study to genetically classify the BVDV strains found were included. This thesis led to the development of a highly sensitive RT-qPCR that detects all bovine genotypes found in the region. In addition, BVDV RNA could be recovered for up to 12 months on chromatography paper and FTA cards. No viral circulation was found at the monitored dairy farm. Prevalence estimates showed high viral circulation in the dairy farms collected in Santa Fe. Sequenced samples indicate broader circulation of 1b genotype. Updated data on DVB in Santa Fe was obtained, reflecting the need to implement control plans at the regional level.